Отдел рукописей и редких изданий был создан на базе сектора редких книг в 1994 г., фонд которого был выделен из основного книгохранилища в 1977 году. Основными видами деятельности являются библиографическое описание рукописей, ведение справочно-поискового аппарата, а также научно-исследовательская и научно-методическая работа.
На сегодняшний день отдел рукописей и редких изданий имеет одно из самых богатых собраний уникальных изданий дореволюционного и послереволюционного периода в республике — около 50 тыс. наименований, в хронологическом плане относящихся к XVI–XX веков. По видовому составу фонд можно разделить на рукописные книги, печатные книги, периодические (газеты, журналы), картографические (атласы) и изобразительные (альбомы) издания. По языковой характеристике документы распределяются следующем образом: на русском языке — 55%; на языках народов России (башкирском, татарском) — 35%; на языках стран Азии и Африки (арабском, персидском, турецком и др.) — 10%. Из них 913 экз. можно отнести к числу уникальных: в том числе палеотипы (европейские печатные книги, изданные с 1 января 1501 г. до 1 января 1551 г.), и книги ручного пресса (1551–1830).
Самым ранним печатным изданием является «Богословие четырёх книг Дамаскина с комментариями и разъяснениями» (Париж, 1512) Иоанна Дамаскина (675–749) — византийского философа и богослова, известного как «Защитник истины». Он при жизни заслужил славу «златострунного», на славянский язык его перевёл знаменитый Андрей Курбский, современные учёные признали его «великим систематизатором».
Особый интерес у исследователей вызывают рукописные книги XV — начала XX в. Всего в фонде их 220 экз. на арабском, персидском, тюрки, русском и башкирском языках. Среди них — восемь тетрадей из коллекции башкирского известного башкирского поэта и просветителя Гали Сокороя (1826–1889) и его сына, учёного-просветителя Гарифулы Киикова (1861–1918), религиозно-дидактические произведения анонимных авторов и переписчиков, поэтические, религиозные и научные сборники. В тематическом плане они относятся преимущественно к таким разделам, как мусульманское право (фикх), грамматика арабского языка, логика, философия, корановедение, хадисология, медицина и т. д. Из них оригиналы — 13 рукописей, переписанные копии оригиналов рукописей (ПКОР) — 123, комментарии — 60, субкомментарии — 21. Большинство источников представляют собой ПКОР произведений IX–XIV вв., по времени создания датируются ХVII–ХIХ веками.
Флюр Шарифуллинович Сибагатов, кандидат филологических наук, доцент, заведующий отделом рукописей и редких изданий Национальной библиотеки им. А.-З. Валиди РБ,